miRNA功能预测的数据分析

达为科优势

原理

miRNA与对应的靶基因存在负调控关系，因此可以将表达谱分析得到的差异基因与miRNA靶基因取交集后对miRNA做负相关分析，在构建靶基因之间的调控关系网络后，加入对应miRNA对靶基因的调控关系，从而方便地研究miRNA对整个靶基因信号转导流程的转录后调控过程。

服务流程

筛选差异基因。
通过TargetScan的方法预测MicroRNA的靶基因，得到差异MicroRNA能够调控的靶基因。
根据差异基因和差异MicroRNA的数据作MicroRNA-mRNA的负相关分析，得到和差异MicroRNA表达趋势相反的靶基因。
对上一步得到的靶基因进行功能分析，得到可靠的、显著性的、靶向的基因功能。
根据靶基因功能的分析结果，构建基因功能之间相互作用的网络。（GO-Map）
对靶基因进行显著性信号通路分析，得到靶基因参与的准确的、可靠的、显著的信号通路。（Pathway-Analysis）
根据显著性信号通路的分析结果，构建显著性信号通路的网络，从中发现上游信号通路、中枢信号通路和下游效应信号通路。（Path-Net）
对显著性功能结果和显著性信号通路结果中包含的靶基因取交集，得到交集靶基因。
根据MicroRNA-靶基因的关系，构建MicroRNA调控交集靶基因的网络，从中发现调控能力强的MicroRNA以及被调控的多的靶基因。（MicroRNA-Gene-Net）
基于靶基因的显著性功能分析，构建MicroRNA与交集靶基因功能的网络，从中发现调控能力强的MicroRNA和受调控多的基因功能。（MicroRNA-GO-Network）

服务流程

步骤	客户提供	服务内容	诺百提供
1	1、目的miRNA信息；2、靶细胞及相关信息；靶蛋白抗体（如果需要）及其他生物学功能分析相关信息及材料	设计、合成Pre-miR miRNA模拟物或miRNA抑制剂
2		（方案一）质粒构建，转染细胞。	质粒测序报告
		（方案二）慢病毒包装，侵染细胞	慢病毒液（1E6 – 1E7 TU/ml）；病毒滴度数据
		（方案三）腺病毒包装，侵染细胞	腺病毒液（1E8 – 1E9 pfu/ml）；病毒滴度数据
3		TaqMan探针检测靶基因表达水平的变化	检测报告
4	可用的靶蛋白抗体	免疫学方法检测靶蛋白表达水平的变化	检测报告

注意：此项目在步骤1启动。客户可根据具体需求选择感兴趣的方案作为步骤2。同时，客户可指定项目在哪一步终止。