毛细管电泳存在问题：

　　f 使用了小管径的毛细管，制备能力差

　　f 光路短，要用高灵敏度的检测器检测样品

　　f 凝胶、色谱填充管要用专门的灌制技术

　　f 大的侧面/截面积比会“放大”吸附的作用，导致蛋白质等的分离效率下降或无峰

　　f 吸附会引起电渗的变化，进而影响分离重现性