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课题外包-Affymetrix基因表达谱芯片经济型解决方案
2011年 5 月,上海拜沃生物技术有限公司引进 Affymetrix GeneAtlas™ 系统,利用 Affymetrix 全新的条形( strip )芯片制式为广大科研工作者提供表达谱研究经济型解决方案。
服务特色
经济简便:全新的条形strip格式,同时处理4个样本,降低单个芯片服务成本。
探针更新:芯片探针设计根据新版数据库进行,使您可以利用新版数据库信息进行您的课题研究。
系统方案:九年来,SBC表达谱服务项目已达千余项,客户发表相关文章203篇(影响因子总计达589.995)。
SBC将汇集多年项目成功经验,为您提供针对表达谱研究的系统解决方案。
服务推荐 — 3’ 端表达谱芯片服务( 4 samples / strip )
服务推荐 — 全转录本表达谱芯片服务( 4 samples / strip )
实验流程
服务相关
1. 样品要求
1)样品纯度:OD 260/280值应在1.9~2.2 之间;DNA 应该去除干净;
2)样本完整性:Agilent 2100 score ≥ 7;
3)样品浓度:最低浓度不低于100ng/µl;
4)样品总量:每个样品总量不少于5µg;
5)样品溶剂:要溶解在H20或TE (pH 8.0)中;
6)样品运输:RNA用冻存管保存,并用干冰或液氮运输。
2. 生物信息学分析
1)表达谱数据归一化处理(normalization)
2)统计学分析
a. 倍数差异计算筛选
b. T检验和SAM检验
c. 一维方差分析
d. 二维方差分析
e. 主成分分析
f. 聚类分析
3)功能注释:
a. 差异基因基本信息注释
b. 差异基因的GO富集分析
c. 差异基因的Pathway富集度分析
d. 差异基因编码的蛋白质相互作用关联查询
e. 差异基因对应的microRNA关联查询
联系人:黄力
电话:
邮箱:hyperheal@gmail.com
联系QQ:2764246
- 询价产品:课题外包-Affymetrix基因表达谱芯片经济型解决方案 课题外包
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