长确定为的味道和气味在饮用水源，藻类引起的一些在超出客户投诉水处理厂的问题。无论是在淡水资源和海洋来源，藻类大量繁殖增加运营成本，并能对人体健康的威胁。

在海洋环境中，有害藻华（HAB），常因它们的颜色称为赤潮，会严重扰乱海水淡化厂的运作。这些藻类大量繁殖产生多种有毒物质，包括功能强大的神经毒素对人体健康构成威胁。在淡水，藻类被称为主要是为促进释放两个素罪犯，土臭素和2-甲基异冰片（2-MIB），为细胞代谢物的味道和气味的投诉。然而，蓝藻某些菌株（这是不实际藻类，但蓝藻）也能产生神经毒素，导致一些监管部门考虑更严格的监控。

与混凝，沉淀，过滤常规治疗植物，藻类通过堵塞进水口，屏，堰和过滤器中断操作。由藻类需要更多混凝剂，增加氯气的需求，减少过滤器的运行时间，增加反冲洗，降低产水量，并要求经营者及时进行清理进水口，屏，堰和过滤器提高运营成本。如果完整的藻类细胞不会被删除它们分解，释放出进攻的味道和气味成分，MIB和土臭素，需要昂贵的碳处理以去除。对于海水淡化厂，影响甚至可以更具破坏性，因为藻类可以盲目过滤器或超滤预处理系统，减少产量，增加运营成本，增加废品率和潜在关停整个治疗列车。